Eliza és a jótékonykodás, mintha egymás szinonímái lennének. a színésznő ahol csak tud, segít, és más sztárokkal ellentétben nem csinál ezekből nagy ügyet, nem kürtöli világgá, nem rángat magával fotósokat, épp ezért nem is mindegyik jó cselekedetéről lehet tudni.

2006-ban sok más sztár mellett ő is a Teddy Bear Project tagja volt, ahol a különböző sorozatok színészei pózoltak egy kis macival, amellyel a mellrák veszélyességére próbálták felhívni a figyelmet. Eliza mellett olyan kollégái adták arcukat a kampányhoz, mint Nicholas Brendon, Alyson Hannigan, James Marsters, David Boreanaz, Amber Benson és még sok más Whedon sorozatos színész. (és egyébként maga Joss Whedon) is.

Persze pénzügyileg is támogat, ha csak tud, a Camp Hale Alumni Association-t például, amely nehéz sorsú gyerekek üdüléseit biztosítja évente segíti egy nagyobb összeggel.

2008 nyarán Ugandába látogatott, hogy az ottani, egykor harcolásra kényszerített gyerekeket látogassa meg, és ismerje meg az életvitelüket. Ezt az utazást egyébként Eliza édesanyja szervezte.Nagyban hozzájárult ezzel hogy az ottani fiatalok számára megépítsék a régen várt ifijúsági házat és tanítási centrumot.

“Annyi mindent megtanulhatsz, amikről egyébként sosem olvashatsz... találkozni emberekkel, és elsőkézből hallani a történeteiket... Utálom azt hallani, hogy mások az ő [az egykori gyerekkatonák] korukban unatkoznak."